这是一个忍者依然在舞台上活跃的世界。然而，现如今的忍者多数为富豪和政要效劳，帮助他们从事一些不可告人的活动，这使得那些丧失信仰的忍者被称为“恶忍”。为了对抗不断壮大的恶忍势力，政府创立了半藏学院，将其打造成为培养“善忍”的地方。天真可爱的焰（喜多村英梨 配音）、出身贫寒却拥有极其坚韧意志的咏（芽野爱衣 配音）、沉默寡言且不流露情感的日影（白石凉子 配音）、看似稚嫩实则自身身材颇为在意的未来（后藤沙绪里 配音）、心机深重却实际上内心充满母性光辉的春花（丰口惠美 配音），在学校中，这五位少女相遇了。